186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1500 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  100 
 
 		 220 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.23 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  34.68 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  33.78 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  33.78 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  33.03 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  31.02 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  32.88 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  33.63 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  32.57 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  36.53 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  42.62 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  30.41 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  30.56 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  35.94 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  30.87 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  31.3 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.18 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  38.76 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  31.84 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  31.84 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  30.99 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  27.04 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  45.88 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  27.63 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  45.88 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  35.83 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  28.38 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  38.35 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29.13 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  27.44 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  35.48 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  26.11 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  28.7 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  28.42 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  33.59 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  25.23 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  29.55 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  29.55 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  29.55 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  27.44 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  25.88 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  34.41 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  30.29 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  32.65 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  27.31 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  26.64 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  43.75 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  43.33 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  43.33 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  40.91 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  32.73 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  25.68 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  26.82 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  26.27 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  35.16 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.43 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  36.47 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 157 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  27.32 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  30.4 
 
 		 153 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  25.23 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.85 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 245 aa  51.6  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7538  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 139 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.0410709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  35.48 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  33.72 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 120 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  46.3 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.16 
 
 		 132 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  29.09 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.02 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4345  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.759199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  23.56 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  34.91 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  33.93 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  24.08 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  35.16 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  25.55 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  32.63 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0868  putative phage repressor  25.44 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000901562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>