More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1492 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
624 aa  1273    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
592 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
589 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
584 aa  302  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
571 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
581 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  35.42 
 
 
537 aa  287  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
587 aa  280  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  32.39 
 
 
599 aa  279  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
593 aa  276  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  32.59 
 
 
581 aa  270  8e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  34.3 
 
 
591 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  32.82 
 
 
581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
590 aa  257  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
594 aa  252  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
590 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
606 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
608 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
597 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
599 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
615 aa  243  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
489 aa  236  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
596 aa  236  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  28.95 
 
 
598 aa  236  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
585 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
458 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
595 aa  228  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  32.45 
 
 
584 aa  228  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
602 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
602 aa  223  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
608 aa  220  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  29.95 
 
 
575 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
678 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
591 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
444 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  49.38 
 
 
376 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
612 aa  217  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 
376 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
611 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
607 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 
376 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  31.46 
 
 
613 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
600 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
571 aa  211  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 
571 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
460 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
608 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
619 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
401 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
609 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  28.43 
 
 
571 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
585 aa  206  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
597 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  26.97 
 
 
587 aa  206  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  31.46 
 
 
613 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  27.49 
 
 
587 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  27.32 
 
 
587 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  26.97 
 
 
587 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  31.46 
 
 
613 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  26.97 
 
 
587 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 
587 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  31.24 
 
 
613 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  26.69 
 
 
587 aa  203  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  31.24 
 
 
613 aa  203  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  31.24 
 
 
613 aa  203  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
585 aa  203  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  31.24 
 
 
613 aa  203  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  31.24 
 
 
613 aa  203  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  27.32 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  31.24 
 
 
613 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  26.88 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  27.32 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
377 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
587 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
412 aa  195  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
412 aa  195  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
597 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
418 aa  194  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
468 aa  193  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
423 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
590 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
604 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
591 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
571 aa  187  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
456 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  28.99 
 
 
589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
422 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
623 aa  184  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
621 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  34.46 
 
 
346 aa  179  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
614 aa  178  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  27.05 
 
 
591 aa  177  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
591 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>