More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1432 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1432  pyruvate kinase  100 
 
 
569 aa  1167    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  45.42 
 
 
480 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  45.4 
 
 
474 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  43.22 
 
 
478 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  44.96 
 
 
471 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  44.33 
 
 
479 aa  361  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  44.59 
 
 
491 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  42.25 
 
 
477 aa  355  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  41.4 
 
 
597 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  41.4 
 
 
596 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  42.56 
 
 
479 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  42.61 
 
 
476 aa  351  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  46.65 
 
 
480 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  41.4 
 
 
596 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  41.75 
 
 
476 aa  350  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  40.52 
 
 
476 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  43.86 
 
 
471 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  43.27 
 
 
489 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  42.95 
 
 
471 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42 
 
 
596 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  40.79 
 
 
485 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41.29 
 
 
485 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  40.04 
 
 
581 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  44.87 
 
 
480 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  42.86 
 
 
487 aa  343  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  42.77 
 
 
489 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  42.77 
 
 
489 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  38.78 
 
 
583 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  44.02 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  41.48 
 
 
481 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  40.92 
 
 
578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  41.79 
 
 
481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  38.95 
 
 
580 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1978  pyruvate kinase  41.05 
 
 
484 aa  336  5e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.65271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  42.36 
 
 
483 aa  337  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  41.04 
 
 
483 aa  336  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  44.05 
 
 
582 aa  337  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0227  pyruvate kinase  41.05 
 
 
484 aa  336  5e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.930918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  41.27 
 
 
496 aa  337  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  40.08 
 
 
470 aa  336  7.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  38.7 
 
 
585 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  41.09 
 
 
489 aa  335  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  42.73 
 
 
505 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  37.94 
 
 
588 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  42.42 
 
 
471 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  39.96 
 
 
585 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  39.36 
 
 
472 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  44.29 
 
 
509 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  41.89 
 
 
476 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  39.36 
 
 
472 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  41.54 
 
 
478 aa  334  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  41.13 
 
 
478 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  37.7 
 
 
585 aa  333  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  37.52 
 
 
585 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  36.84 
 
 
587 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  43.61 
 
 
480 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  37.5 
 
 
585 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  37.5 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  37.5 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  37.5 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  37.6 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  37.5 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  37.5 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  39.5 
 
 
482 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  37.5 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  42.11 
 
 
474 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  41.61 
 
 
474 aa  329  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  38.97 
 
 
584 aa  329  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2597  pyruvate kinase  40.65 
 
 
488 aa  329  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.384426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  40.22 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.04 
 
 
580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  42.41 
 
 
481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  38.45 
 
 
585 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  38.39 
 
 
479 aa  326  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  43.79 
 
 
471 aa  326  9e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  41.94 
 
 
605 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  40.22 
 
 
482 aa  325  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  40.51 
 
 
496 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  40.04 
 
 
478 aa  324  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  42.42 
 
 
494 aa  324  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  40.26 
 
 
472 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  41.93 
 
 
474 aa  323  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  39.33 
 
 
583 aa  323  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  39.48 
 
 
594 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  40.34 
 
 
472 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  40.9 
 
 
472 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  37.23 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  40.13 
 
 
582 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  38.63 
 
 
592 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  38.63 
 
 
592 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  41.52 
 
 
486 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  42.08 
 
 
474 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  37.34 
 
 
601 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  42.75 
 
 
461 aa  317  4e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  39.54 
 
 
495 aa  317  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  40.56 
 
 
476 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  39.8 
 
 
481 aa  317  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  42.14 
 
 
472 aa  316  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  38.87 
 
 
590 aa  316  6e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  37.16 
 
 
577 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>