More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1415 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
609 aa  1245    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  40.53 
 
 
636 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  40.73 
 
 
639 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  39.76 
 
 
647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  39.53 
 
 
643 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  39.9 
 
 
645 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  38.96 
 
 
645 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  41.26 
 
 
629 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  40.54 
 
 
630 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  39.48 
 
 
642 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  40.77 
 
 
631 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  41.91 
 
 
681 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  41.33 
 
 
629 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  41.33 
 
 
629 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  41.33 
 
 
629 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  42.76 
 
 
626 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  40.88 
 
 
646 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  39.69 
 
 
628 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  41.02 
 
 
647 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  41.58 
 
 
640 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  40.88 
 
 
611 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  40.54 
 
 
646 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  38.85 
 
 
634 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  39.86 
 
 
602 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 
630 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  40.71 
 
 
619 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  39.86 
 
 
602 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  40.94 
 
 
646 aa  425  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  40.91 
 
 
631 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  40.91 
 
 
631 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.65 
 
 
618 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  38.31 
 
 
618 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 
618 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 
618 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  40.17 
 
 
640 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  40.41 
 
 
648 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 
618 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  39.62 
 
 
648 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 
618 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  40.2 
 
 
624 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 
646 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  38.08 
 
 
618 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  39.05 
 
 
630 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  40.47 
 
 
649 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  39.83 
 
 
647 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  41.81 
 
 
630 aa  415  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  38.7 
 
 
631 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  38.91 
 
 
629 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  38.02 
 
 
627 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.59 
 
 
640 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  37.26 
 
 
703 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  37.84 
 
 
618 aa  412  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  39.76 
 
 
630 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.37 
 
 
667 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  36.1 
 
 
673 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 
618 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  36.82 
 
 
610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 
618 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 
618 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 
618 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
610 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  36.63 
 
 
618 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  38.41 
 
 
629 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  40.65 
 
 
681 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  37.81 
 
 
766 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  39.23 
 
 
648 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  39.23 
 
 
648 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  39.01 
 
 
627 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  38.82 
 
 
655 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
637 aa  404  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  37.31 
 
 
618 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 
793 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  37.86 
 
 
643 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 
803 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  37.16 
 
 
607 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  38.51 
 
 
809 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  38.68 
 
 
803 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 
632 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  39.05 
 
 
683 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  37.32 
 
 
760 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  37.85 
 
 
756 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 
802 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 
678 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 
765 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 
765 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  37.36 
 
 
775 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  37.61 
 
 
597 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 
802 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 
802 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 
802 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  37.85 
 
 
764 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  35.91 
 
 
628 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  38.84 
 
 
648 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 
802 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  37.71 
 
 
655 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  37.31 
 
 
617 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 
761 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  37.17 
 
 
632 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  37.77 
 
 
650 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>