122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1371 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  65.91 
 
 		 497 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  65.91 
 
 		 327 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  65.91 
 
 		 325 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  65.91 
 
 		 329 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  65.91 
 
 		 333 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  65.91 
 
 		 441 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  65.91 
 
 		 325 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  65.91 
 
 		 325 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  65.91 
 
 		 325 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  67.25 
 
 		 325 aa  216  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  67.25 
 
 		 325 aa  216  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  57.39 
 
 		 329 aa  193  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  62.94 
 
 		 323 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  60.95 
 
 		 323 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  59.17 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  59.17 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  55.11 
 
 		 333 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  55.11 
 
 		 321 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  55.11 
 
 		 321 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  56.8 
 
 		 463 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  59.88 
 
 		 323 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  59.3 
 
 		 323 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  41.36 
 
 		 288 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  56.41 
 
 		 284 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  44.85 
 
 		 330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  44.85 
 
 		 330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  44.85 
 
 		 330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  44.85 
 
 		 330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  40.43 
 
 		 289 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  40.43 
 
 		 289 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 289 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  46.81 
 
 		 288 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 330 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  40.43 
 
 		 302 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 348 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  44.68 
 
 		 288 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 355 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  56.14 
 
 		 272 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  40.46 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  38.95 
 
 		 289 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  38.95 
 
 		 289 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  38.95 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  38.95 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  38.95 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 329 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 329 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 327 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  41.76 
 
 		 316 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  50.89 
 
 		 336 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 316 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 316 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 316 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 316 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 316 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 316 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  37.22 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  40.59 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  38.64 
 
 		 332 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  38.64 
 
 		 343 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  44.78 
 
 		 293 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  40.36 
 
 		 321 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  37.14 
 
 		 323 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  38.82 
 
 		 463 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  39.88 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  36.42 
 
 		 319 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  36.42 
 
 		 319 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  36.42 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  36.42 
 
 		 319 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  36.42 
 
 		 319 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  36.47 
 
 		 314 aa  106  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  39.74 
 
 		 303 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  37.36 
 
 		 330 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  34.12 
 
 		 284 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  37.65 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1683  hypothetical protein  50.86 
 
 		 275 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  39.26 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  35.12 
 
 		 314 aa  101  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  34.71 
 
 		 320 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  36.24 
 
 		 157 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.16 
 
 		 265 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1518  hypothetical protein  48.94 
 
 		 101 aa  92.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  37.59 
 
 		 277 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  44.95 
 
 		 286 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  44.95 
 
 		 329 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  40.37 
 
 		 259 aa  84.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  43.12 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2980  hypothetical protein  41.12 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653613  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  71.74 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  55.36 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>