More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1369 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  100 
 
 
272 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  69.03 
 
 
301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  66.79 
 
 
336 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  66.79 
 
 
336 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  66.42 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  63.88 
 
 
259 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  34.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  34.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  34.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  34.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  34.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  34.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  34.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  34.57 
 
 
785 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  34.57 
 
 
495 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  34.57 
 
 
479 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0782  integrase, catalytic region  36.12 
 
 
237 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  35.27 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 
326 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5451  Integrase catalytic region  33.07 
 
 
326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5505  Integrase catalytic region  33.07 
 
 
326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  35.44 
 
 
353 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  33.09 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4138  integrase catalytic subunit  32.59 
 
 
326 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  29.96 
 
 
324 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
266 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  29.96 
 
 
324 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  29.96 
 
 
324 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  29.96 
 
 
324 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  33.04 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
205 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  30.18 
 
 
274 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  33.33 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  32.7 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  32.7 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  32.7 
 
 
196 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  32.7 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  32.7 
 
 
240 aa  90.1  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  32.7 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  32.7 
 
 
281 aa  89  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  32.08 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  32.7 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  32.08 
 
 
284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  31.1 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  31.1 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6766  Integrase catalytic region  27.55 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  32.08 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>