92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1304 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  99.3 
 
 		 712 aa  1442    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  78.37 
 
 		 720 aa  1166    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  97.75 
 
 		 712 aa  1420    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  84.55 
 
 		 716 aa  1250    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 		 712 aa  1449    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  99.86 
 
 		 712 aa  1449    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  40.06 
 
 		 731 aa  547  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  40.2 
 
 		 682 aa  526  1e-148  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  51.13 
 
 		 765 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  53.82 
 
 		 759 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  50 
 
 		 760 aa  292  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  51.31 
 
 		 755 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  35.66 
 
 		 667 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  40.83 
 
 		 739 aa  100  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  37.78 
 
 		 930 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  26.45 
 
 		 590 aa  92.8  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  39.05 
 
 		 272 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  36.32 
 
 		 841 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  28.16 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  30.59 
 
 		 834 aa  83.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  30.04 
 
 		 838 aa  82  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  26.46 
 
 		 597 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  27.27 
 
 		 610 aa  80.5  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  29.41 
 
 		 979 aa  80.1  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  24.86 
 
 		 756 aa  73.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  32.64 
 
 		 847 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  33.33 
 
 		 788 aa  73.6  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  27.21 
 
 		 299 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  40.66 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  30.64 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.97 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  28.26 
 
 		 283 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  26.52 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  37.3 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  25.17 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  35.65 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  36.21 
 
 		 346 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  29.73 
 
 		 845 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  34.21 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  36.75 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  41.56 
 
 		 610 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  40 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  33.62 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  26.83 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  38.54 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  34.19 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  36.08 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  33.04 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  34.42 
 
 		 880 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  35.04 
 
 		 353 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  35.9 
 
 		 353 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  33.05 
 
 		 354 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  32.52 
 
 		 346 aa  55.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  34.58 
 
 		 357 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  32.76 
 
 		 350 aa  55.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  35.05 
 
 		 351 aa  55.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  31.78 
 
 		 354 aa  54.7  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  27.93 
 
 		 277 aa  53.9  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  40.51 
 
 		 350 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  24.07 
 
 		 294 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  26.41 
 
 		 892 aa  53.9  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.2 
 
 		 654 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  30.77 
 
 		 351 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  31.82 
 
 		 732 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  25.96 
 
 		 452 aa  52  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  36.46 
 
 		 342 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  40.96 
 
 		 665 aa  51.6  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  34.02 
 
 		 346 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  33.04 
 
 		 344 aa  51.2  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  33.04 
 
 		 344 aa  51.2  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0320  hypothetical protein  31.48 
 
 		 127 aa  50.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  27.36 
 
 		 362 aa  50.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  34.62 
 
 		 345 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  32.26 
 
 		 701 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  27.31 
 
 		 389 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  34.02 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  31.86 
 
 		 345 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  36.84 
 
 		 345 aa  48.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  26.39 
 
 		 759 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  32.99 
 
 		 346 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  35.71 
 
 		 796 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  27.08 
 
 		 358 aa  45.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  25.91 
 
 		 646 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  27.34 
 
 		 348 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  26.13 
 
 		 728 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  32.69 
 
 		 621 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  28.28 
 
 		 841 aa  44.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  24.67 
 
 		 719 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 867 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  33.05 
 
 		 815 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  23.81 
 
 		 842 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  27.31 
 
 		 368 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>