17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1196 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1196  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  811    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000270508  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0210  hypothetical protein  41.61 
 
 
421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0881  hypothetical protein  30.88 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0619  hypothetical protein  32.89 
 
 
355 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1137  hypothetical protein  25.81 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0110326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1007  hypothetical protein  25.48 
 
 
465 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000130692  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0620  hypothetical protein  29.55 
 
 
324 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.691086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0751  hypothetical protein  29.85 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000284515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0316  hypothetical protein  28.86 
 
 
337 aa  92.8  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3030  hypothetical protein  23.71 
 
 
530 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2888  hypothetical protein  23.4 
 
 
530 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2619  hypothetical protein  28.06 
 
 
333 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1887  hypothetical protein  23.05 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0304  hypothetical protein  22.99 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2001  hypothetical protein  29.84 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0796567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0608  hypothetical protein  26.86 
 
 
327 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00667196  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3475  hypothetical protein  24.16 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000973715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>