113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1081 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
399 aa  837    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  64.56 
 
 
395 aa  528  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  65.04 
 
 
392 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  61.64 
 
 
398 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  61.87 
 
 
396 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  61.65 
 
 
400 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  63.54 
 
 
396 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  60.65 
 
 
400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  62.28 
 
 
396 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  61.44 
 
 
401 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  62.66 
 
 
403 aa  511  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  61.75 
 
 
405 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  60.41 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  60.15 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  58.61 
 
 
397 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  61.21 
 
 
399 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  59.09 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  59.95 
 
 
398 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  57.07 
 
 
403 aa  489  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  55.81 
 
 
401 aa  490  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  59.95 
 
 
399 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  55.3 
 
 
401 aa  484  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  58.19 
 
 
404 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  55.05 
 
 
401 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  56.6 
 
 
394 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  58.75 
 
 
405 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  59.18 
 
 
398 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  61.42 
 
 
403 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  59.38 
 
 
397 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  57.93 
 
 
402 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  54.55 
 
 
401 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  56.42 
 
 
405 aa  480  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  57.97 
 
 
401 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  57.64 
 
 
409 aa  477  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  54.29 
 
 
403 aa  471  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  58.67 
 
 
398 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  55.3 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  59.18 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  58.93 
 
 
398 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  58.93 
 
 
398 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  44.33 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  43.1 
 
 
414 aa  336  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  42.61 
 
 
417 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  42.61 
 
 
414 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  42.12 
 
 
413 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  41.48 
 
 
412 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  40.54 
 
 
414 aa  318  7.999999999999999e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  42.08 
 
 
412 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  42.08 
 
 
412 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  40.35 
 
 
413 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  40.44 
 
 
412 aa  315  8e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  39.66 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  39.66 
 
 
413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  39.41 
 
 
426 aa  312  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  40.89 
 
 
424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  40.39 
 
 
424 aa  305  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  40.29 
 
 
412 aa  305  8.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  39.51 
 
 
414 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  39.51 
 
 
414 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  38.92 
 
 
413 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  39.8 
 
 
422 aa  295  8e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  38.68 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  38.68 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  39.65 
 
 
407 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  30.52 
 
 
408 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  30.73 
 
 
403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  32.19 
 
 
401 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
407 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
407 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
407 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  28.4 
 
 
407 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  25.06 
 
 
398 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.16 
 
 
415 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  25.75 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  21.72 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.02 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.08 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.83 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.89 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  24.82 
 
 
446 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  22.73 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.73 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  22.73 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.23 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.73 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  22.73 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  22.16 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.66 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  21.64 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25.86 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  23 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  22.44 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.52 
 
 
748 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.33 
 
 
394 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  24.75 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  20.14 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.57 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  26.35 
 
 
418 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  24.66 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  25.68 
 
 
388 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>