267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1077 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0262  AAA family ATPase  56.94 
 
 
558 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.673428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18070  ATPase, AAA superfamily  56.05 
 
 
585 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1771  AAA ATPase central domain protein  56.33 
 
 
570 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1077  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
567 aa  1169    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0956592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1175  ATPase central domain-containing protein  53.46 
 
 
574 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700331  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2165  ATPase  55.56 
 
 
560 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1217  AAA ATPase central domain protein  54.31 
 
 
565 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000255374  hitchhiker  0.0000000181039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2338  ATPase central domain-containing protein  54.29 
 
 
571 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1499  ATPase, AAA family  54.66 
 
 
553 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.790722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0047  ATPase central domain-containing protein  52.11 
 
 
608 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0274  AAA family ATPase  38.54 
 
 
547 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0342467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6755  ATPase central domain-containing protein  38.3 
 
 
540 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4172  AAA ATPase, central region  37.85 
 
 
540 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4152  AAA ATPase central domain protein  35.12 
 
 
534 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  34.31 
 
 
822 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01591  conserved hypothetical protein  48.8 
 
 
924 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181362  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07091  hypothetical protein  35.21 
 
 
753 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 
697 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03615  conserved hypothetical protein  40.24 
 
 
1049 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.391595  normal  0.0454206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 
725 aa  88.2  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  31.79 
 
 
639 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  30.69 
 
 
744 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  30.93 
 
 
662 aa  84.7  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  33.15 
 
 
656 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  31.56 
 
 
432 aa  84  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  33.57 
 
 
743 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  27.67 
 
 
787 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  31.41 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  34.29 
 
 
725 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  32.41 
 
 
656 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  30.53 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  26.84 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  32.86 
 
 
657 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  30.56 
 
 
678 aa  77.8  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  32.64 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  32.24 
 
 
634 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  28.96 
 
 
299 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  32.24 
 
 
749 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  33.75 
 
 
772 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  28.64 
 
 
619 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 
697 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  34.38 
 
 
795 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  35 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 
1193 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  35.22 
 
 
687 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  32.64 
 
 
680 aa  73.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  33.11 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  33.12 
 
 
698 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  26.79 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  33.14 
 
 
771 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  34.42 
 
 
450 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  33.75 
 
 
773 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  31.21 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  30.19 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  36.3 
 
 
766 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  30.99 
 
 
671 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  30.86 
 
 
1085 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  29.94 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  30.56 
 
 
652 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  26.64 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  30.64 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  33.76 
 
 
773 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  31.01 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  30.69 
 
 
771 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  32.37 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  30.6 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  30.11 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
775 aa  67.4  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  29.61 
 
 
646 aa  67.4  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  31.16 
 
 
682 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  28.85 
 
 
697 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  29.56 
 
 
711 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  32.35 
 
 
689 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  26.14 
 
 
570 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  28.95 
 
 
788 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  25.49 
 
 
570 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  34.09 
 
 
369 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  26.38 
 
 
570 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  33.81 
 
 
369 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  25.49 
 
 
570 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  27.93 
 
 
956 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  29.56 
 
 
445 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  32.67 
 
 
789 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  26.01 
 
 
781 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  26.06 
 
 
228 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  28.87 
 
 
622 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  28.88 
 
 
577 aa  63.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  28.38 
 
 
239 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  32.05 
 
 
789 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  27.59 
 
 
371 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  31.84 
 
 
731 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  29.18 
 
 
601 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  35.77 
 
 
753 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  27.51 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  35.34 
 
 
360 aa  59.3  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  31.54 
 
 
573 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  27.4 
 
 
729 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>