More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1073 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  879    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 424 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  57.7 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1686  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.162047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  55.81 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 422 aa  494  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 424 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 424 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 438 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  491  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 426 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2353  seryl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>