More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1037 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
339 aa  706    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
332 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
332 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.36 
 
 
332 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
332 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
332 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
332 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
332 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
332 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
334 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
334 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
334 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
332 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
332 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
332 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
332 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
334 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
346 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 
335 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
346 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
334 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
334 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
334 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
346 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
334 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
332 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
334 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
334 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
334 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
334 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
334 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0246  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
336 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
334 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  58.72 
 
 
334 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
335 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
337 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
333 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
334 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.57 
 
 
336 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 
338 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
338 aa  384  1e-105  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 
327 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
345 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
365 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
332 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 
338 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
337 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
341 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
328 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
344 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
348 aa  358  5e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
344 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
329 aa  358  8e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
344 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
329 aa  355  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
329 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
329 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
327 aa  352  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
329 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
329 aa  350  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
337 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
331 aa  345  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
355 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
336 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
332 aa  341  9e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
346 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
336 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
351 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
346 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
336 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
339 aa  325  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0575  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
329 aa  325  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.415055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
342 aa  325  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
337 aa  322  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
352 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
337 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl192  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
350 aa  320  3e-86  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00755732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
341 aa  319  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0995  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
329 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1014  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
329 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00140566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
347 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>