More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0988 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  64.16 
 
 
469 aa  634    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  64.16 
 
 
469 aa  634    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  63.68 
 
 
477 aa  634    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  66.81 
 
 
469 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  63.3 
 
 
468 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  64.74 
 
 
469 aa  643    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  64.09 
 
 
469 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  63.87 
 
 
469 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  100 
 
 
473 aa  991    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  65.67 
 
 
468 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  64.54 
 
 
486 aa  636    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  63.73 
 
 
469 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  63.44 
 
 
469 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  63.87 
 
 
469 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 
469 aa  631  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  62.58 
 
 
468 aa  632  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  63.68 
 
 
469 aa  634  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  63.89 
 
 
469 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  64.1 
 
 
469 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  63.33 
 
 
469 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  62.18 
 
 
469 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0147  L-glutamine synthetase  63.95 
 
 
469 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0281822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  63.3 
 
 
469 aa  628  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  63.11 
 
 
470 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  63.23 
 
 
468 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  62.72 
 
 
471 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1780  glutamine synthetase, type I  63.95 
 
 
469 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  631  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  62.72 
 
 
471 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1344  glutamine synthetase, type I  63.73 
 
 
469 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  62.61 
 
 
469 aa  626  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  63.58 
 
 
469 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  62.82 
 
 
469 aa  626  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  62.8 
 
 
469 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  62.72 
 
 
469 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  63.44 
 
 
469 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  63.15 
 
 
469 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  62.69 
 
 
470 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  63.36 
 
 
469 aa  621  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  63.15 
 
 
469 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  63.28 
 
 
469 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  63.38 
 
 
467 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  63.15 
 
 
469 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  61.97 
 
 
469 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  61.19 
 
 
471 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  63.58 
 
 
469 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2288  glutamine synthetase, type I  61.54 
 
 
469 aa  618  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  63.15 
 
 
471 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  61.19 
 
 
471 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  62.8 
 
 
469 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3454  glutamine synthetase  62.82 
 
 
469 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00170098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  61.62 
 
 
471 aa  618  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  62.5 
 
 
469 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  62.47 
 
 
471 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  63.58 
 
 
469 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  61.19 
 
 
471 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0418  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 
468 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.910839  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  64.09 
 
 
471 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  60.55 
 
 
471 aa  614  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  61.95 
 
 
472 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  60.98 
 
 
471 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  62.18 
 
 
469 aa  617  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  61.97 
 
 
469 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  60.55 
 
 
471 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  61.94 
 
 
469 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  62.39 
 
 
469 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  60.98 
 
 
471 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  62.93 
 
 
469 aa  616  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  60.55 
 
 
471 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  61.42 
 
 
471 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0359  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  62.15 
 
 
468 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  60.55 
 
 
471 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0344  L-glutamine synthetase  62.53 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
471 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3484  glutamine synthetase, type I  62.63 
 
 
472 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.31098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>