More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0973 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  38.5 
 
 
1135 aa  651  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  40.94 
 
 
1134 aa  670  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  43.25 
 
 
1146 aa  835  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  43.68 
 
 
1118 aa  776  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  36.72 
 
 
1155 aa  645  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  39.23 
 
 
1110 aa  783  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  39.14 
 
 
1110 aa  783  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  43.87 
 
 
1132 aa  799  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  40.98 
 
 
1196 aa  785  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  100 
 
 
1155 aa  2304  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  35.42 
 
 
1076 aa  603  1e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  36.32 
 
 
1182 aa  599  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.53 
 
 
1129 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  35.07 
 
 
1076 aa  596  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  32.29 
 
 
1162 aa  298  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 
1080 aa  170  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 
1187 aa  150  1e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 
1173 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 
1185 aa  145  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  27.23 
 
 
1157 aa  144  1e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  26.62 
 
 
1180 aa  137  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  26.55 
 
 
1180 aa  134  1e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  26.83 
 
 
1061 aa  131  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.52 
 
 
1226 aa  130  2e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 
1173 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 
1173 aa  128  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 
1147 aa  128  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.83 
 
 
1156 aa  128  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  25.98 
 
 
1125 aa  127  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.97 
 
 
1156 aa  125  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 
1162 aa  124  1e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 
772 aa  124  1e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 
776 aa  123  2e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.11 
 
 
1155 aa  122  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 
1149 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  23.6 
 
 
1218 aa  122  5e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  26.24 
 
 
1244 aa  117  1e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  26.14 
 
 
1241 aa  117  2e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.87 
 
 
1241 aa  116  2e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  28.63 
 
 
1124 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.69 
 
 
772 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.23 
 
 
1119 aa  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.49 
 
 
1217 aa  114  8e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  21.77 
 
 
1121 aa  114  8e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.51 
 
 
797 aa  114  8e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.49 
 
 
1217 aa  114  8e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0306  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.58 
 
 
802 aa  114  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.87 
 
 
1241 aa  114  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.87 
 
 
1241 aa  114  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 
1161 aa  114  1e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.92 
 
 
1240 aa  114  1e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03281  UvrD/REP helicase  24.58 
 
 
802 aa  114  1e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  26.05 
 
 
1241 aa  113  2e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.87 
 
 
1241 aa  113  2e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.87 
 
 
1241 aa  113  2e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.87 
 
 
1241 aa  113  2e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.7 
 
 
1241 aa  113  2e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03271  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 
802 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  26.79 
 
 
1242 aa  112  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  21.55 
 
 
854 aa  111  8e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.47 
 
 
794 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  25.31 
 
 
1157 aa  107  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  31.23 
 
 
1117 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  26.39 
 
 
1392 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 
1074 aa  106  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.37 
 
 
796 aa  106  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  28.13 
 
 
1087 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.73 
 
 
1230 aa  105  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  27.37 
 
 
1151 aa  105  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 
1196 aa  105  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 
1120 aa  103  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 
1161 aa  103  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 
798 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.16 
 
 
781 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.16 
 
 
781 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  26.65 
 
 
1164 aa  102  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.29 
 
 
1203 aa  101  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 
800 aa  101  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.68 
 
 
1089 aa  100  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25 
 
 
1057 aa  101  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.85 
 
 
785 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  25.25 
 
 
816 aa  100  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.85 
 
 
785 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03371  UvrD/REP helicase  22.52 
 
 
802 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.08 
 
 
1139 aa  99  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 
809 aa  97.8  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  24.68 
 
 
1392 aa  97.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.82 
 
 
1111 aa  97.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1341  UvrD/REP helicase  33.21 
 
 
1195 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.638227  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.16 
 
 
1204 aa  97.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3878  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 
1111 aa  97.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.95 
 
 
784 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 
1121 aa  96.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.83 
 
 
1262 aa  96.3  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.38 
 
 
805 aa  95.9  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 
805 aa  95.9  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4232  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.81 
 
 
781 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491131  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  26.46 
 
 
1187 aa  95.9  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.79 
 
 
1233 aa  95.5  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  31.29 
 
 
1110 aa  95.1  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>