More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0963 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  100 
 
 
244 aa  490  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  45.66 
 
 
223 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  47.25 
 
 
223 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  45.21 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  44.3 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  42.15 
 
 
221 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  45.21 
 
 
223 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  44.04 
 
 
223 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  44.93 
 
 
224 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  43.42 
 
 
223 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  43.36 
 
 
229 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  41.28 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  42.98 
 
 
239 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  43.35 
 
 
222 aa  144  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  44.89 
 
 
224 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  43.95 
 
 
243 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  42.99 
 
 
222 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  43.05 
 
 
223 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  40.83 
 
 
237 aa  141  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  46.19 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  41.99 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  43.53 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  39.21 
 
 
232 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  38.96 
 
 
239 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  43.38 
 
 
222 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  42.67 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  38.1 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  43.23 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  45.45 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  40.79 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  42.04 
 
 
222 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  41.52 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  41.2 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  41.59 
 
 
222 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  41.7 
 
 
221 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  41.26 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  42.29 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  42.29 
 
 
225 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  42.29 
 
 
225 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  39.58 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  37.77 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  41.44 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  39.37 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  36.04 
 
 
324 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
236 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  40.68 
 
 
245 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  37.8 
 
 
252 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 
249 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  37.07 
 
 
240 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  38.94 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  40.95 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  39.21 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  43.95 
 
 
228 aa  125  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  40.09 
 
 
221 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 
220 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
252 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 
240 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 
241 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  38.89 
 
 
234 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  41.23 
 
 
240 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  39.59 
 
 
250 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 
240 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  37.17 
 
 
232 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  42.25 
 
 
210 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
234 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  37.66 
 
 
230 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  38.43 
 
 
240 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  37.34 
 
 
236 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  41.48 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 
241 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  38.84 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  37.22 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  37.44 
 
 
227 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  39.82 
 
 
223 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  32.41 
 
 
320 aa  118  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  38.29 
 
 
221 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  36.71 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  35.81 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  39.64 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.29 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  35.59 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  37.77 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  35.59 
 
 
248 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 
245 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  35.29 
 
 
219 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  35.68 
 
 
242 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  35.9 
 
 
226 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  35.9 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  35.48 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  36.63 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>