More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0948 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  57.53 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  58.06 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  59.34 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  55.38 
 
 		 188 aa  224  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  51.63 
 
 		 189 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  58.24 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  54.26 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  54.26 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  50.81 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  51.09 
 
 		 189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  52.43 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  51.63 
 
 		 188 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  51.09 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  51.35 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  50.54 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  51.35 
 
 		 190 aa  208  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  48.65 
 
 		 188 aa  207  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  50.27 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  51.63 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  52.17 
 
 		 188 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  50.27 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  49.45 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 188 aa  204  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  50.28 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  51.34 
 
 		 191 aa  203  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  49.73 
 
 		 189 aa  204  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  50.81 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  49.46 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  50.28 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  50.81 
 
 		 191 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 191 aa  197  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  48.07 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  48.09 
 
 		 189 aa  194  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  50.28 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  44.09 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  44.62 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  44.62 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  46.15 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  46.15 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  46.15 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  50.28 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  44.09 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  51.09 
 
 		 190 aa  184  6e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  44.57 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  47.03 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  41.62 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  45.16 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  43.55 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  50.55 
 
 		 183 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  48.62 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  40.98 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  40.64 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  42.39 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  40.11 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  41.18 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  42.39 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  40.64 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  42.08 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  40.64 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  43.96 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  41.53 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  41.18 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  37.84 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>