More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0908 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  51.17 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  48.15 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  47.97 
 
 		 301 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 		 301 aa  295  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  48.3 
 
 		 302 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 		 301 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 		 301 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  47.14 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 298 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  48.12 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 299 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 299 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  50.82 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  50.33 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.33 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  50.33 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 		 299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  47.81 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  46.44 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  46.82 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 		 303 aa  265  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  48.03 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 309 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  46.71 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 301 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  43.85 
 
 		 338 aa  252  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  43.85 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 329 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  43.54 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  43.33 
 
 		 305 aa  248  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  47.33 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 332 aa  248  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  41.24 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 334 aa  242  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>