More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0869 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  247  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  73.77 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  176  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2142  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2457  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2179  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.980549  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  167  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  166  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  166  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  61.98 
 
 		 123 aa  164  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  59.02 
 
 		 122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 127 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 125 aa  163  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  62.81 
 
 		 121 aa  163  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 118 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  65.81 
 
 		 118 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  65.81 
 
 		 118 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  65.81 
 
 		 118 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 123 aa  157  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 123 aa  157  5e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 120 aa  157  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  65.81 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  157  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>