More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0864 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  64.94 
 
 		 199 aa  209  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  58.86 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  56.4 
 
 		 189 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  57.22 
 
 		 189 aa  205  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  56.4 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  65.77 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  59.28 
 
 		 189 aa  204  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  58.68 
 
 		 186 aa  203  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  56.07 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  55.93 
 
 		 186 aa  200  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 192 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 		 189 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  59.38 
 
 		 195 aa  198  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  61.29 
 
 		 189 aa  197  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  58.75 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  61.94 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  64.43 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 190 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 187 aa  192  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 191 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  60.39 
 
 		 163 aa  190  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  60.67 
 
 		 187 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  53.41 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  59.74 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  55.28 
 
 		 162 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 191 aa  187  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 242 aa  184  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  59.09 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  58 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 162 aa  181  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 162 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  56.25 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  61.04 
 
 		 237 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  59.09 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  56.21 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 171 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  56.21 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  53.05 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  52.47 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  56.86 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  52.3 
 
 		 170 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  54.66 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0595  30S ribosomal protein S5  54 
 
 		 174 aa  169  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0331863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  46.24 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0336  30S ribosomal protein S5  47.09 
 
 		 175 aa  167  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000198476  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3321  30S ribosomal protein S5  47.9 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0426  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 174 aa  167  7e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.712709  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 215 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  46.24 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  55.1 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  51.53 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  55.1 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  49.07 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0664  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 170 aa  164  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0314639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  53.74 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  48.12 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  53.74 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  49.07 
 
 		 168 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>