More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0856 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 		 83 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  66.25 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  66.25 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  67.5 
 
 		 80 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  67.5 
 
 		 80 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  67.5 
 
 		 80 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  67.61 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 78 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 80 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  68.06 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  66.18 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  65.28 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0265  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.696196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  65.28 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  67.65 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 92 aa  98.2  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  65.22 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 80 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  67.65 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 80 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 80 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  62.5 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  57.78 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  67.65 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  67.65 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  66.18 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  66.2 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  67.65 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 93 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  69.12 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  66.18 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 83 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  61.11 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  61.11 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 82 aa  93.6  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  57.53 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>