More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0853 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  74.04 
 
 		 223 aa  328  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  73.68 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  69.05 
 
 		 210 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  69.86 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  69.05 
 
 		 211 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  69.05 
 
 		 211 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  69.86 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  70.33 
 
 		 248 aa  310  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  69.38 
 
 		 235 aa  310  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  70.53 
 
 		 210 aa  310  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  68.9 
 
 		 210 aa  310  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  70.33 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  70.81 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  71.29 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  70.33 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  69.57 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  70.81 
 
 		 235 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  68.6 
 
 		 211 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  68.9 
 
 		 236 aa  308  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  70.33 
 
 		 232 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  68.9 
 
 		 236 aa  308  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  69.23 
 
 		 228 aa  308  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  69.23 
 
 		 220 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  69.38 
 
 		 239 aa  307  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  69.38 
 
 		 248 aa  307  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  68.9 
 
 		 236 aa  307  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  67.46 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  70.33 
 
 		 236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  69.86 
 
 		 232 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  67.63 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  67.46 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  69.38 
 
 		 231 aa  305  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  67.94 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 236 aa  304  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 236 aa  304  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  68.9 
 
 		 231 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  68.42 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  67.94 
 
 		 252 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  66.99 
 
 		 239 aa  301  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  67.32 
 
 		 234 aa  300  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  67.63 
 
 		 225 aa  300  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  67.15 
 
 		 225 aa  299  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  66.99 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  66.99 
 
 		 238 aa  298  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 256 aa  298  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  66.83 
 
 		 235 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 238 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 238 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  65.55 
 
 		 240 aa  296  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  65.07 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  66.67 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 229 aa  295  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  62.86 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1347  30S ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 231 aa  294  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  66.98 
 
 		 228 aa  294  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  66.03 
 
 		 229 aa  294  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  62.2 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  64.93 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  62.2 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  66.34 
 
 		 308 aa  293  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  62.2 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  65.85 
 
 		 285 aa  292  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1846  30S ribosomal protein S3  68.69 
 
 		 226 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00843492  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  65.55 
 
 		 226 aa  291  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 228 aa  291  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  67.14 
 
 		 228 aa  291  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  66.83 
 
 		 226 aa  291  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 228 aa  291  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 226 aa  291  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  65.55 
 
 		 229 aa  291  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  66.03 
 
 		 234 aa  291  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  65.07 
 
 		 230 aa  291  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 286 aa  291  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1255  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.378037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0591  30S ribosomal protein S3  64.25 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  64.76 
 
 		 213 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>