More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0851 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  100 
 
 
92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  73.91 
 
 
92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  71.74 
 
 
92 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  71.11 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  68.13 
 
 
92 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  134  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  134  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
94 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  68.82 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  131  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
87 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  72.09 
 
 
93 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 
93 aa  130  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
92 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 
93 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 
93 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 
93 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  70.93 
 
 
93 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  66.3 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  65.59 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
90 aa  127  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
94 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  64.52 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  70.11 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  63.74 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216881  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  63.74 
 
 
91 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000040228  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  124  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>