More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0850 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  67.63 
 
 
276 aa  382  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  67.63 
 
 
276 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 
277 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 
274 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  67.63 
 
 
276 aa  378  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 
274 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 
274 aa  367  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  64.75 
 
 
275 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 
274 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
279 aa  360  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 
280 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  62.23 
 
 
278 aa  360  1e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  61.87 
 
 
275 aa  359  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
274 aa  358  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
276 aa  358  7e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 
280 aa  356  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 
275 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  62.82 
 
 
274 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
280 aa  354  6.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  61.01 
 
 
276 aa  354  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  62.82 
 
 
274 aa  354  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
274 aa  354  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 
276 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 
275 aa  351  8e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
279 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 
279 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
278 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 
279 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
278 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
276 aa  349  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
276 aa  349  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
276 aa  349  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
276 aa  349  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
276 aa  349  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 
273 aa  349  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
276 aa  349  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
276 aa  349  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  59.35 
 
 
276 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  59.35 
 
 
276 aa  347  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  65.7 
 
 
273 aa  347  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  59.35 
 
 
276 aa  347  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  59.35 
 
 
276 aa  346  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 
280 aa  346  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
279 aa  345  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_004310  BR1230  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 
277 aa  344  8.999999999999999e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 
274 aa  344  8.999999999999999e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 
276 aa  344  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1843  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
278 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0328595  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1193  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 
277 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
278 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 
277 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 
277 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  59.42 
 
 
274 aa  342  4e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0989  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
278 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.0318056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
275 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 
283 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.86 
 
 
276 aa  339  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
277 aa  338  8e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626221  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
277 aa  338  8e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
277 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
277 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  59.21 
 
 
275 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 
275 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  60.44 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1335  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 
278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0836019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2298  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.749096  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
275 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3664  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 
278 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1433  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 
278 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  0.0219433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 
277 aa  335  7e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 
278 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 
275 aa  334  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
276 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  64.62 
 
 
277 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 
277 aa  333  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 
276 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  58.84 
 
 
273 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  58.21 
 
 
279 aa  332  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1617  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 
279 aa  331  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
276 aa  331  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
276 aa  331  8e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
276 aa  331  8e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
277 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
277 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 
277 aa  330  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
274 aa  330  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  57.91 
 
 
275 aa  330  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0577  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 
279 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 
275 aa  328  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2969  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 
276 aa  328  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1548  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 
277 aa  328  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
273 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
273 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
277 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3445  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 
277 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1367  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.266089  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 
276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>