More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0842 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 123 aa  248  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 123 aa  218  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  218  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  214  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  214  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 136 aa  213  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  213  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  213  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  213  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 125 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 124 aa  210  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  210  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  210  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  210  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1863  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  210  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000968975  normal  0.252117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2157  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.949049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2435  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2118  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  209  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1903  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  209  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3914  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0358  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0968074  normal  0.576972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  207  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  207  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2213  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  207  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 137 aa  207  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  207  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  207  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 127 aa  207  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  206  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  0.0000000329491 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 128 aa  206  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4322  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00668981  unclonable  0.000000000093676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  206  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0179  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00020988  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 135 aa  206  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  206  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  206  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000216882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0143  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000877595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  205  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  205  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>