15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0802 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0802  hypothetical protein  100 
 
 		 662 aa  1350    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000629904  normal  0.50337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2943  hypothetical protein  41.44 
 
 		 659 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1178  hypothetical protein  38.78 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3623  hypothetical protein  36.9 
 
 		 651 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0338  hypothetical protein  36.28 
 
 		 651 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000473528  normal  0.110861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3802  hypothetical protein  36.66 
 
 		 651 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000317632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3491  hypothetical protein  35.49 
 
 		 651 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000969843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0056  hypothetical protein  34.9 
 
 		 660 aa  369  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00640513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0298  hypothetical protein  35.08 
 
 		 652 aa  365  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000564529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3690  hypothetical protein  33.68 
 
 		 657 aa  365  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000260745  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1858  hypothetical protein  34.52 
 
 		 660 aa  362  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153141  normal  0.576375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0004  hypothetical protein  36.15 
 
 		 660 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0351  hypothetical protein  30.78 
 
 		 634 aa  263  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000201568  normal  0.805939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  22.63 
 
 		 634 aa  51.2  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  32.23 
 
 		 800 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>