More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0704 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
575 aa  1179    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
575 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
586 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
597 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
581 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
583 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
597 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
592 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
583 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
586 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
580 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
580 aa  505  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
556 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
597 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
597 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
584 aa  497  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
605 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
554 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0902  arginyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
580 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.0464581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
559 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
554 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
598 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  45 
 
 
554 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
598 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
590 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3935  arginyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
576 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
586 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
598 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2480  arginyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
586 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299544  normal  0.119664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
590 aa  477  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
585 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
585 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1870  arginyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
581 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116057  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1779  arginyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
592 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0946273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2767  arginyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0538697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
561 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
589 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
585 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3587  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
594 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.919979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
551 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
557 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2675  arginyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
585 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
585 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
589 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1138  arginyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
575 aa  465  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
611 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
570 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
585 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
561 aa  465  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0877  arginyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
585 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
592 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1089  arginyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
585 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
561 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
556 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
585 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
551 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
551 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
562 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
586 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0868  arginyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
585 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0402  arginyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
568 aa  449  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
561 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
556 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
585 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
551 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
598 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0495  arginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
598 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
609 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0112  arginyl-tRNA synthetase  44 
 
 
580 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
559 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
564 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0443  arginyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
597 aa  439  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
551 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
550 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0537  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
576 aa  436  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
556 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
556 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
553 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
553 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
568 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>