More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0703 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  44.72 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  48.97 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  49.17 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  47.46 
 
 		 201 aa  168  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.99 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.81 
 
 		 191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  46.49 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  42.19 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  45.56 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  48.04 
 
 		 190 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  46.11 
 
 		 188 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  46.67 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  43.52 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  46.11 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  46.99 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  42.25 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  44.89 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  44.26 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  44.32 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  41.11 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  39.53 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  42.2 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.72 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  37 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.89 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 		 243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  36.99 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  35.6 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.76 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.91 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  36.67 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.4 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  33.16 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  41.14 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  35.71 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.16 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.77 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  32.82 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.77 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.18 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.18 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  34.53 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.18 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>