142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0696 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0696  Na+/H+ antiporter-like protein  100 
 
 		 82 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00158966  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  98.46 
 
 		 396 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.24 
 
 		 397 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  60 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.97 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  57.63 
 
 		 425 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.07 
 
 		 397 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.23 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  57.63 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  50 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2430  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.67 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  54.84 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.72 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.84 
 
 		 382 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.58 
 
 		 400 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.18 
 
 		 391 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.58 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.21 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  58.62 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  37 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  50 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0533  Na+/H+ antiporter  45.88 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.38 
 
 		 391 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.08 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38 
 
 		 391 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.56 
 
 		 398 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  36 
 
 		 389 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2293  Na+/H+ antiporter NhaA  48.33 
 
 		 395 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.08 
 
 		 389 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.89 
 
 		 401 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.39 
 
 		 388 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.39 
 
 		 388 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  36 
 
 		 389 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.39 
 
 		 388 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.46 
 
 		 391 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.39 
 
 		 388 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  50 
 
 		 409 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.39 
 
 		 388 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.93 
 
 		 391 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.39 
 
 		 395 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 396 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  43.75 
 
 		 630 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.38 
 
 		 399 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  46.05 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.79 
 
 		 397 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  53.97 
 
 		 401 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.79 
 
 		 397 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.39 
 
 		 394 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.79 
 
 		 391 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.39 
 
 		 394 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  51.72 
 
 		 460 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  46.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  50 
 
 		 394 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.15 
 
 		 388 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 388 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  44.29 
 
 		 391 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  38.71 
 
 		 408 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  43.08 
 
 		 876 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  48.28 
 
 		 424 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.55 
 
 		 420 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.55 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  48.53 
 
 		 382 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.58 
 
 		 455 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  40.62 
 
 		 439 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3487  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 395 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2304  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.5 
 
 		 384 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.28 
 
 		 400 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  47.46 
 
 		 465 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2448  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 382 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.73 
 
 		 395 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  50 
 
 		 392 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  40 
 
 		 427 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.06 
 
 		 399 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  50 
 
 		 392 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  46.67 
 
 		 376 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.56 
 
 		 399 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.72 
 
 		 396 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.72 
 
 		 396 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.21 
 
 		 392 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  43.08 
 
 		 514 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  45.76 
 
 		 444 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  45.9 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.03 
 
 		 400 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  45.61 
 
 		 470 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  52 
 
 		 453 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  47.37 
 
 		 464 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  39.06 
 
 		 617 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 393 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  44.64 
 
 		 396 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  45.31 
 
 		 413 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 452 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>