37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0694 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  58.66 
 
 
190 aa  226  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  57.46 
 
 
191 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  57.46 
 
 
191 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  57.46 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  58.01 
 
 
190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  57.46 
 
 
191 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  51.43 
 
 
189 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  56.91 
 
 
190 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  53.94 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  52.38 
 
 
189 aa  199  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  53.44 
 
 
188 aa  197  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  47.85 
 
 
191 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  45.16 
 
 
191 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  45.81 
 
 
194 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  45.2 
 
 
192 aa  147  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  49.61 
 
 
143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  40.12 
 
 
186 aa  101  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  35.14 
 
 
196 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  40.6 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  35.56 
 
 
196 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  36.57 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  34.29 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  35.52 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  33.51 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  36.76 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  31.43 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  31.43 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  30.12 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  32.2 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  32.95 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  27.03 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  26.63 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  44.33 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  28 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  26.63 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>