More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0605 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
395 aa  823    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.78 
 
 
370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.55 
 
 
371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.88 
 
 
372 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.61 
 
 
372 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.32 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.5 
 
 
372 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.52 
 
 
388 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.56 
 
 
373 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.15 
 
 
375 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.84 
 
 
376 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.54 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.88 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.56 
 
 
376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.89 
 
 
370 aa  441  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.01 
 
 
376 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.88 
 
 
383 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.44 
 
 
382 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.28 
 
 
376 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.65 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.88 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  58.61 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.13 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
380 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.2 
 
 
374 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.73 
 
 
371 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.56 
 
 
377 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.56 
 
 
377 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.3 
 
 
379 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.84 
 
 
377 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.22 
 
 
381 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
387 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.3 
 
 
379 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
374 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
381 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
387 aa  434  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.12 
 
 
377 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
374 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.52 
 
 
374 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
375 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
374 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
374 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.78 
 
 
374 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.22 
 
 
381 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
379 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.45 
 
 
371 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.26 
 
 
373 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.84 
 
 
377 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.1 
 
 
374 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.89 
 
 
370 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  59 
 
 
375 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.5 
 
 
375 aa  431  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 
376 aa  431  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.06 
 
 
374 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.06 
 
 
374 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
374 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.06 
 
 
374 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.78 
 
 
374 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
374 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
374 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.22 
 
 
369 aa  428  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.56 
 
 
391 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
370 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.78 
 
 
374 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.1 
 
 
371 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.62 
 
 
377 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.78 
 
 
374 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
374 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.17 
 
 
370 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.98 
 
 
379 aa  428  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.86 
 
 
374 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.32 
 
 
369 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.29 
 
 
372 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.46 
 
 
370 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.57 
 
 
370 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.98 
 
 
385 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.71 
 
 
379 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
377 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  58.89 
 
 
371 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
375 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.3 
 
 
377 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.29 
 
 
372 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.64 
 
 
375 aa  425  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.84 
 
 
380 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
377 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  57.14 
 
 
382 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
374 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.5 
 
 
367 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>