More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0529 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  100 
 
 
150 aa  303  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  63.38 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 
149 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 
144 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
148 aa  147  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  57.55 
 
 
143 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
148 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  55.64 
 
 
143 aa  141  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  58.59 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 
156 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  54.96 
 
 
153 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 
150 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
140 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  50 
 
 
150 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  50 
 
 
150 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
157 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  53.54 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  48.91 
 
 
154 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
171 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
171 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
171 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  46.97 
 
 
144 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 
135 aa  105  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
139 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 
137 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  46.27 
 
 
156 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
132 aa  100  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 
212 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
176 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
236 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
229 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  37.32 
 
 
237 aa  77.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  41.67 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  42.86 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
269 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.51 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
229 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
286 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 
232 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  33.61 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
303 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.04 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
190 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  42.7 
 
 
224 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
228 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
248 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
273 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
242 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
181 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
284 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
248 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.84 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  37.84 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  48.15 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 
231 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
153 aa  53.9  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>