More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0494 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1088 aa  2207    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
911 aa  320  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.2 
 
 
1039 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
1105 aa  313  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 
1424 aa  307  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.62 
 
 
1068 aa  300  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
924 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
785 aa  266  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 
1288 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.09 
 
 
1328 aa  218  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
1262 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  27.25 
 
 
934 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 
1050 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
953 aa  208  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  25.66 
 
 
1056 aa  208  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  27.92 
 
 
829 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
1215 aa  206  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.8 
 
 
1404 aa  206  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 
1429 aa  206  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 
1185 aa  205  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  26.29 
 
 
845 aa  204  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 
1128 aa  204  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.77 
 
 
1212 aa  204  8e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  25.65 
 
 
843 aa  201  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
857 aa  198  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
1283 aa  198  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  25.55 
 
 
1324 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  25.73 
 
 
1500 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  28.15 
 
 
675 aa  194  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.63 
 
 
2145 aa  192  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  28.71 
 
 
897 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  27.03 
 
 
859 aa  191  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.3 
 
 
1131 aa  189  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 
454 aa  189  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 
767 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  27.3 
 
 
713 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  26.23 
 
 
900 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.25 
 
 
801 aa  186  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 
787 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  25.71 
 
 
992 aa  184  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.54 
 
 
1044 aa  184  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
814 aa  184  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 
963 aa  183  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 
1186 aa  182  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.12 
 
 
1550 aa  181  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  26.89 
 
 
849 aa  180  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.38 
 
 
828 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 
771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.97 
 
 
1040 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  26.45 
 
 
838 aa  175  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.08 
 
 
1314 aa  174  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  34.65 
 
 
825 aa  172  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.32 
 
 
885 aa  172  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  25.31 
 
 
1309 aa  172  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
444 aa  171  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  26.58 
 
 
1000 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
966 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.51 
 
 
732 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 
1507 aa  167  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
843 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
568 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 
568 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 
1136 aa  162  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  26.15 
 
 
1383 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.44 
 
 
822 aa  159  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.64 
 
 
991 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.65 
 
 
793 aa  156  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 
1290 aa  154  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 
1125 aa  154  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
776 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  24.16 
 
 
1509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 
284 aa  148  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 
1914 aa  148  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.06 
 
 
1228 aa  148  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  24.76 
 
 
977 aa  147  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  25.29 
 
 
899 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  24.34 
 
 
1523 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  30.09 
 
 
457 aa  146  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
837 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  25.32 
 
 
1311 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
443 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
751 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
1714 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.79 
 
 
799 aa  138  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.8 
 
 
725 aa  138  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.02 
 
 
694 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  23.46 
 
 
1261 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 
577 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
949 aa  131  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  24.79 
 
 
1146 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  34.3 
 
 
702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  33.62 
 
 
311 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.89 
 
 
493 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  23.93 
 
 
680 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.39 
 
 
740 aa  128  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.47 
 
 
672 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.28 
 
 
686 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 
919 aa  125  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
909 aa  125  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  24.06 
 
 
1010 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>