More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0485 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.12 
 
 
698 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.93 
 
 
708 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.82 
 
 
699 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.67 
 
 
698 aa  738    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.15 
 
 
697 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.14 
 
 
693 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
697 aa  1442    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.26 
 
 
698 aa  773    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.89 
 
 
756 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.97 
 
 
693 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.33 
 
 
695 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.63 
 
 
691 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.31 
 
 
691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.21 
 
 
698 aa  532  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.3 
 
 
689 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.34 
 
 
723 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.35 
 
 
706 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.48 
 
 
724 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.5 
 
 
718 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.45 
 
 
691 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.45 
 
 
691 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.31 
 
 
691 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.49 
 
 
754 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.78 
 
 
691 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.52 
 
 
749 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.05 
 
 
712 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.4 
 
 
734 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.42 
 
 
713 aa  460  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.25 
 
 
708 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 
729 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.9 
 
 
979 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.62 
 
 
745 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.51 
 
 
766 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.57 
 
 
788 aa  452  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.47 
 
 
733 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.52 
 
 
712 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 
704 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  41.34 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.62 
 
 
679 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.8 
 
 
714 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.37 
 
 
741 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.58 
 
 
706 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.45 
 
 
762 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.97 
 
 
756 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.64 
 
 
706 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.44 
 
 
448 aa  259  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.3 
 
 
624 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.2 
 
 
545 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.8 
 
 
543 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.84 
 
 
588 aa  200  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 
593 aa  200  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 
593 aa  200  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.56 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.61 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.21 
 
 
602 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.73 
 
 
718 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.34 
 
 
630 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.29 
 
 
1376 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.33 
 
 
634 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.88 
 
 
451 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.23 
 
 
605 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.69 
 
 
535 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.38 
 
 
543 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.38 
 
 
543 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.26 
 
 
606 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  32.61 
 
 
493 aa  194  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.08 
 
 
646 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.89 
 
 
557 aa  194  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.62 
 
 
705 aa  194  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.32 
 
 
591 aa  193  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.29 
 
 
626 aa  193  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.45 
 
 
731 aa  194  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.12 
 
 
709 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.72 
 
 
568 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.49 
 
 
617 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.12 
 
 
626 aa  192  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.67 
 
 
709 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.69 
 
 
593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.68 
 
 
606 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.84 
 
 
725 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.68 
 
 
595 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  34.1 
 
 
597 aa  189  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 
709 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.78 
 
 
722 aa  188  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.86 
 
 
527 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.41 
 
 
595 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 
600 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.02 
 
 
556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  32.85 
 
 
734 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.67 
 
 
737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.77 
 
 
562 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  28.93 
 
 
552 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.2 
 
 
636 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.81 
 
 
724 aa  185  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  36.16 
 
 
637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.61 
 
 
729 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.25 
 
 
705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.21 
 
 
721 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.4 
 
 
637 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  33.97 
 
 
705 aa  184  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>