More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0467 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  100 
 
 		 450 aa  917    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  43.67 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  44.74 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  41.8 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  42.18 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  40.71 
 
 		 450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  41.43 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  41.44 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  40.63 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  41.8 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  41.57 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  40.36 
 
 		 446 aa  329  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  40.47 
 
 		 450 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  40.58 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  41.98 
 
 		 435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  40.24 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  40.48 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  39.14 
 
 		 441 aa  322  9.000000000000001e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  38.89 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  39.15 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  41.24 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  40.48 
 
 		 462 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  37.35 
 
 		 444 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  39.86 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  37.35 
 
 		 444 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  37.35 
 
 		 444 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  39.76 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  39.86 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  40.05 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  40.58 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  38.44 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  37.21 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.47 
 
 		 448 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.44 
 
 		 446 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  38.77 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.45 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  36.46 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.35 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.35 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.53 
 
 		 442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  36.09 
 
 		 469 aa  272  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  36.94 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  38.04 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.07 
 
 		 442 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  36.36 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  36.55 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  36.51 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36.18 
 
 		 429 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  37.53 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  38.21 
 
 		 426 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  35.44 
 
 		 427 aa  259  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  36.36 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  38.46 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  35.86 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  35.36 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  33.91 
 
 		 451 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  37.07 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  36.07 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  35.37 
 
 		 432 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  39.11 
 
 		 435 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  36.93 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  35.45 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.8 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  34.68 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  36.78 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  34.93 
 
 		 437 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  39.22 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  34.17 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.92 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  37.05 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  34.59 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  35.31 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  35 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  36.54 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34.12 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  33.87 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  33.49 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  36.14 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  34.55 
 
 		 443 aa  240  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  33.18 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  32.96 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  32.96 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  35.32 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.74 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  33.12 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32.81 
 
 		 431 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33.98 
 
 		 421 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  35.65 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  32.81 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  35.01 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  33.04 
 
 		 442 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  34.78 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>