More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0415 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 490 aa  1018    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 455 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 456 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  52.51 
 
 		 485 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 480 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 505 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 485 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 460 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 460 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1349  cysteinyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 460 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 461 aa  481  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 459 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 459 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 473 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2091  cysteinyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1085  cysteinyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189428  normal  0.0293604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>