229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0354 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
109 aa  228  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  65.38 
 
 
105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  60.38 
 
 
109 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  56.07 
 
 
106 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  56.19 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 
103 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
108 aa  129  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 
103 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 
103 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  58.1 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  57.58 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
102 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  56.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  57.28 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  53.4 
 
 
107 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  52.83 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  52.83 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  58.59 
 
 
110 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  56.31 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  56.31 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  56.31 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  54.81 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  56.31 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  56.31 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  56.31 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  55.77 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
109 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  59.38 
 
 
109 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
109 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  59.18 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0203  glutaredoxin-related protein  52.34 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00589831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  56.19 
 
 
103 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  52.88 
 
 
111 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  54.37 
 
 
110 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  54.37 
 
 
111 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  52.78 
 
 
112 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  51 
 
 
99 aa  121  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  52 
 
 
99 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  53.77 
 
 
109 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 
110 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  53.4 
 
 
111 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  54.37 
 
 
113 aa  120  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  52.88 
 
 
103 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
105 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  55.34 
 
 
103 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  54.29 
 
 
117 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  51.92 
 
 
112 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  52.88 
 
 
103 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  50.94 
 
 
107 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0014  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
111 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.900956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0013  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
111 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1186  glutaredoxin-like protein  53 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  55.24 
 
 
103 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  54.9 
 
 
109 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  52.94 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  54.29 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
111 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  49.04 
 
 
111 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  46.73 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0012  glutaredoxin-like protein  50.49 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  46.73 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  46.73 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  56.44 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  48.08 
 
 
110 aa  114  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  52 
 
 
123 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  49.07 
 
 
109 aa  114  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 
110 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  54.55 
 
 
109 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  45.71 
 
 
110 aa  114  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  47.17 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  47.17 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  54.17 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  52.58 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  50.98 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  48.98 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1760  glutaredoxin-like protein  52.58 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.608629  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  47.62 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  47.62 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  51.85 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  46.23 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  46.23 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  49.07 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  48.48 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  47.47 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  52.13 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48859  predicted protein  49.04 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815373  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  47.47 
 
 
111 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0701  glutaredoxin-like protein  48.48 
 
 
110 aa  111  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.244741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  49.51 
 
 
109 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2584  glutaredoxin-like protein  53.12 
 
 
112 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442279  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  47.47 
 
 
152 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  47.06 
 
 
110 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>