More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0304 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  100 
 
 
464 aa  937    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  47.75 
 
 
614 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.7 
 
 
505 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.6 
 
 
309 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.62 
 
 
314 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.77 
 
 
586 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3868  diguanylate cyclase  31.04 
 
 
517 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.8 
 
 
308 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  39.63 
 
 
565 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.8 
 
 
308 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50 
 
 
797 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  42.25 
 
 
668 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  40.85 
 
 
671 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  47.83 
 
 
721 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.16 
 
 
310 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  44.39 
 
 
464 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  47.46 
 
 
334 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.15 
 
 
322 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.32 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.32 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.18 
 
 
322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.18 
 
 
322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  45.41 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.16 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  45.74 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  45.74 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  45.74 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.18 
 
 
351 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2623  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  49.4 
 
 
626 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.616722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  35.53 
 
 
354 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  45.71 
 
 
555 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  43.26 
 
 
362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0712  diguanylate cyclase  37.04 
 
 
523 aa  147  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.48 
 
 
792 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  51.27 
 
 
378 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0498  diguanylate cyclase  35.46 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.38 
 
 
322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2652  diguanylate cyclase  38.93 
 
 
559 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.261673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.51 
 
 
730 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  45.03 
 
 
696 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  33.81 
 
 
354 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  40.21 
 
 
323 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.85 
 
 
304 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  41.15 
 
 
387 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  42.31 
 
 
370 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  46.99 
 
 
308 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  50.31 
 
 
373 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  46.28 
 
 
510 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  44.44 
 
 
350 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 
476 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.9 
 
 
901 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.28 
 
 
419 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  41.23 
 
 
498 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  42.01 
 
 
278 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  33.44 
 
 
307 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1501  diguanylate cyclase  43.3 
 
 
360 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1466  diguanylate cyclase  41.96 
 
 
307 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412143  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  45.06 
 
 
487 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.96 
 
 
317 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.99 
 
 
301 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  44.25 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.58 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  42.55 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1303  diguanylate cyclase  40.59 
 
 
237 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  46.41 
 
 
753 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0747  diguanylate cyclase  44.51 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1163  diguanylate cyclase  45.45 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  48.47 
 
 
495 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1412  diguanylate cyclase  30.96 
 
 
516 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.25 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  30.34 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  39.15 
 
 
1079 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3087  diguanylate cyclase  39.3 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  39.41 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  45.18 
 
 
303 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.9 
 
 
791 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  40.86 
 
 
316 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.71 
 
 
424 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0384  diguanylate cyclase  40 
 
 
486 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  43.75 
 
 
172 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  46.93 
 
 
736 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1723  response regulator receiver domain-containing protein  43.79 
 
 
325 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03046  GGDEF domain protein  35.65 
 
 
518 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2556  GGDEF domain-containing protein  34.02 
 
 
518 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.44 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.41 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1583  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.62 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185074  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  45.35 
 
 
645 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.86 
 
 
306 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  45.35 
 
 
645 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1433  diguanylate cyclase  44.38 
 
 
387 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.58748  normal  0.153521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.33 
 
 
512 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  38.33 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  40.91 
 
 
340 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0005  diguanylate cyclase  28.98 
 
 
520 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  37.79 
 
 
530 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  29.32 
 
 
507 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  38.14 
 
 
722 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3042  response regulator receiver protein  38 
 
 
388 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>