35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0274 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0274  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000081165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.82 
 
 		 706 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  48.15 
 
 		 1051 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2903  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 		 400 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.097748  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1237  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  34.62 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 846 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3600  putative diguanylate phosphodiesterase  29.67 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  37.31 
 
 		 616 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 483 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 1171 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1451  diguanylate cyclase  40 
 
 		 629 aa  54.7  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0524713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 721 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 709 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 604 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  33.82 
 
 		 499 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 845 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.51 
 
 		 407 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 845 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 994 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0447  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.73 
 
 		 549 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.33 
 
 		 890 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 451 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 412 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0007  putative PAS/PAC sensor protein  30.3 
 
 		 400 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000212043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 1959 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.81 
 
 		 1355 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 473 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 407 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 448 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  29.52 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3576  hypothetical protein  31.48 
 
 		 796 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.966885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3236  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 725 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  30 
 
 		 354 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>