More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0259 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  100 
 
 		 396 aa  818    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  39.79 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.83 
 
 		 411 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.77 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  36.97 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  35.22 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.1 
 
 		 433 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  37.89 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.96 
 
 		 358 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.49 
 
 		 375 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.8 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  37.77 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  36.36 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  33.86 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  35.7 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  35.6 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  39.84 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  38.79 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.2 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  35.88 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  35.83 
 
 		 388 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  35.6 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  38.77 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  37.47 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  33.86 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  38.5 
 
 		 357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.77 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  37.2 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  33.6 
 
 		 373 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  36.87 
 
 		 388 aa  212  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  38.19 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.27 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  33.69 
 
 		 371 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.17 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  37.33 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  36.22 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  37.53 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.85 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  33.15 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.16 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.16 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  34.29 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  37 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  37.5 
 
 		 397 aa  205  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  33.33 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.33 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  35 
 
 		 842 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  36 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.64 
 
 		 395 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.07 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.07 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.25 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  33.33 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.07 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.33 
 
 		 378 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  37.47 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  36.63 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.12 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.98 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  37.8 
 
 		 851 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  36.78 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  37.97 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  34.21 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  35.44 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  34.19 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  36.29 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  36.03 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  33.95 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  37.37 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  35.47 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1349  alanine racemase  36.51 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  38.87 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  34.44 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  36.41 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  35.68 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.47 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  35.28 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  38.27 
 
 		 365 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  35.03 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  35.34 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  36.67 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  35.06 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  35.54 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.94 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  35.07 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  32.63 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  37.1 
 
 		 811 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  32.64 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  35.07 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  33.6 
 
 		 822 aa  192  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  35.41 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  36.7 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  33.42 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>