More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0247 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 
130 aa  266  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  70.73 
 
 
160 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  70.73 
 
 
160 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  65.38 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  65.38 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  69.11 
 
 
160 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  67.48 
 
 
164 aa  173  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  63.57 
 
 
158 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
161 aa  169  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  62.02 
 
 
180 aa  168  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  65.85 
 
 
164 aa  168  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  167  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  64.23 
 
 
160 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  59.23 
 
 
130 aa  168  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 
188 aa  167  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  167  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  63.41 
 
 
161 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 
161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 
157 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  60.98 
 
 
162 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
131 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 
162 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  61.79 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  61.79 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  63.41 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  64.23 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  60.77 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 
161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 
161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  62.3 
 
 
130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  60.98 
 
 
158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  160  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  160  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  58.46 
 
 
130 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  59.23 
 
 
130 aa  160  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 
155 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 
158 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 
158 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 
158 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 
130 aa  159  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  159  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  62.3 
 
 
130 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
158 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
161 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 
158 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>