More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0246 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  302  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 142 aa  199  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 142 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  63.64 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 145 aa  186  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 154 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 154 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 153 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 154 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>