More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0237 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
335 aa  690    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  33.13 
 
 
360 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  39.61 
 
 
331 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 
353 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.72 
 
 
343 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  37.73 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.63 
 
 
336 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  34.3 
 
 
351 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.74 
 
 
363 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  30.98 
 
 
366 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 
381 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  31 
 
 
335 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  36.6 
 
 
349 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  36.27 
 
 
349 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
336 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  37.31 
 
 
347 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  32.41 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  27.91 
 
 
348 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  34.54 
 
 
338 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.94 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.7 
 
 
380 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.41 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 
348 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  31.47 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  36.13 
 
 
339 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  33.12 
 
 
351 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 
343 aa  135  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.27 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  31.63 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.1 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  36.02 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.54 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.89 
 
 
350 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  37.36 
 
 
350 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  36.63 
 
 
350 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  29.64 
 
 
336 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 
353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  35.79 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  35.82 
 
 
370 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  35.82 
 
 
352 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.43 
 
 
313 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  35.82 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  29.25 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  32.04 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.31 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 
338 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  29.77 
 
 
379 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.6 
 
 
367 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.66 
 
 
350 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  35.74 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  30.28 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  34.32 
 
 
362 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.41 
 
 
328 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.12 
 
 
337 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  34.94 
 
 
352 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.74 
 
 
308 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.87 
 
 
341 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.48 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  32.42 
 
 
348 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.89 
 
 
346 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.2 
 
 
361 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.89 
 
 
346 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 
309 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  31.72 
 
 
346 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 
331 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  30.04 
 
 
370 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  30.95 
 
 
345 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  34.77 
 
 
306 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  30.47 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  28.04 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.71 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 
343 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.12 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 
352 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.84 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  32.16 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  31.5 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.13 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.45 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 
374 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  31.1 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.83 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  33.77 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  31.61 
 
 
340 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  30.28 
 
 
341 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 
374 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 
374 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  33.57 
 
 
310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  31.99 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 
368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 
365 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>