More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0203 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  691    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  43.71 
 
 		 684 aa  226  4e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  43.75 
 
 		 489 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.73 
 
 		 831 aa  209  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.62 
 
 		 961 aa  199  9e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1402 aa  195  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  39.22 
 
 		 789 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.06 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.89 
 
 		 557 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.49 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.69 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.69 
 
 		 490 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  38.31 
 
 		 685 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1037 aa  169  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.59 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.7 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.37 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  37.7 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  40.56 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.03 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.86 
 
 		 1032 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1002 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.53 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  35.53 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.89 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  40.61 
 
 		 976 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.47 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.42 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  40.16 
 
 		 256 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.75 
 
 		 865 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.33 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.26 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.35 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.12 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.21 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.01 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1877 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  39.57 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  38.67 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.25 
 
 		 528 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  36.96 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.07 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  39.55 
 
 		 505 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.44 
 
 		 680 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.49 
 
 		 961 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.24 
 
 		 2413 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.87 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.24 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  33.87 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.24 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.11 
 
 		 380 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  30.24 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40.43 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.34 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.91 
 
 		 839 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.49 
 
 		 487 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.1 
 
 		 679 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.89 
 
 		 971 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  35.89 
 
 		 971 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.92 
 
 		 523 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1366 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.48 
 
 		 271 aa  123  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35.21 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.71 
 
 		 565 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  33.53 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.42 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  34.48 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.96 
 
 		 838 aa  119  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.74 
 
 		 512 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.46 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.27 
 
 		 241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  29.43 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  29.43 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  41.08 
 
 		 232 aa  116  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.39 
 
 		 798 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.56 
 
 		 274 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  29.2 
 
 		 509 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 1430 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  29.31 
 
 		 509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.26 
 
 		 890 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.07 
 
 		 208 aa  113  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2590  Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 1012 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.82 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.5 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  27.38 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  28.41 
 
 		 693 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.69 
 
 		 254 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.3 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.88 
 
 		 552 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.12 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  39.11 
 
 		 246 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>