137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0157 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
427 aa  844    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  64.06 
 
 
432 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  63.22 
 
 
440 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  61.52 
 
 
459 aa  504  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  49.54 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  43.95 
 
 
412 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  43.52 
 
 
408 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  41.28 
 
 
409 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  41.34 
 
 
413 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  41.34 
 
 
413 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  39.49 
 
 
419 aa  298  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  41.23 
 
 
417 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  40.6 
 
 
409 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  41.06 
 
 
409 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  41.94 
 
 
409 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  41 
 
 
417 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  42.72 
 
 
408 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  40.92 
 
 
409 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  39.12 
 
 
410 aa  292  9e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  41.34 
 
 
409 aa  292  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  38.68 
 
 
414 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  38.71 
 
 
414 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  41.01 
 
 
409 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  38.75 
 
 
411 aa  289  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  37.76 
 
 
419 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  38.72 
 
 
415 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  38.5 
 
 
415 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  39.22 
 
 
411 aa  285  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  39.5 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  41.01 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  39.44 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  41.03 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  39.31 
 
 
409 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  40.23 
 
 
408 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  40.23 
 
 
408 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  40 
 
 
408 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  40.23 
 
 
408 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  38.75 
 
 
414 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  39.16 
 
 
408 aa  278  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  41.22 
 
 
409 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  42.72 
 
 
408 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  39.37 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  41.5 
 
 
408 aa  274  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  40.78 
 
 
417 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  41.41 
 
 
408 aa  270  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  41.88 
 
 
412 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  42.26 
 
 
409 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  36.48 
 
 
423 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  33.68 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  33.09 
 
 
479 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  58.82 
 
 
201 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  55.23 
 
 
178 aa  196  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  54.65 
 
 
177 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  55.22 
 
 
201 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  56.11 
 
 
202 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  52.05 
 
 
178 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  51.46 
 
 
176 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  53.76 
 
 
177 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  56.57 
 
 
202 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  56.44 
 
 
180 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  55.23 
 
 
177 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  45.55 
 
 
195 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  48.52 
 
 
191 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  49.71 
 
 
177 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  49.71 
 
 
177 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  45.45 
 
 
200 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  45.36 
 
 
210 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  51.52 
 
 
194 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  49.41 
 
 
197 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  49.71 
 
 
176 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  46.78 
 
 
176 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  46.2 
 
 
177 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  50.29 
 
 
173 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  51.45 
 
 
182 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  46.52 
 
 
194 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  50.58 
 
 
201 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  50.58 
 
 
201 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  50.29 
 
 
181 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  45.41 
 
 
194 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0346  nucleoside recognition domain-containing protein  56.38 
 
 
179 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34329  normal  0.440444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  48.8 
 
 
199 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  51.15 
 
 
179 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  43.08 
 
 
201 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  45.66 
 
 
176 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  44.27 
 
 
198 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  45.66 
 
 
176 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  47.37 
 
 
177 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  45.61 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  45.61 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  45.61 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  45.61 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  45.61 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1526  spore maturation protein  45.09 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3819  spore maturation protein  45.09 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000206077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  45.61 
 
 
176 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1195  nucleoside recognition domain-containing protein  45.09 
 
 
176 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  41.75 
 
 
197 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  44.39 
 
 
193 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0166  nucleoside recognition domain protein  44.89 
 
 
176 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00262141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  50 
 
 
408 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>