More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0142 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  100 
 
 
173 aa  352  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  60.95 
 
 
172 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  56.21 
 
 
185 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  55.62 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  52.63 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  52.6 
 
 
169 aa  180  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  55.95 
 
 
185 aa  180  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  54.49 
 
 
196 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  55.03 
 
 
185 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  55.42 
 
 
177 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  53.45 
 
 
193 aa  177  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  50.57 
 
 
171 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  50.57 
 
 
171 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  57.23 
 
 
167 aa  175  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  51.81 
 
 
178 aa  174  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  49.13 
 
 
171 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  56.63 
 
 
167 aa  174  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  56.63 
 
 
167 aa  174  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  55.09 
 
 
178 aa  172  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  53.01 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  47.98 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  51.81 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  50 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  53.89 
 
 
167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  47.46 
 
 
187 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  47.46 
 
 
187 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  54.07 
 
 
167 aa  171  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  50 
 
 
171 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  53.89 
 
 
168 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  51.2 
 
 
167 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  52.12 
 
 
167 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  49.1 
 
 
174 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  52.6 
 
 
169 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  47.4 
 
 
175 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  50.29 
 
 
172 aa  167  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  52.6 
 
 
171 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  54.22 
 
 
167 aa  167  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  50.87 
 
 
168 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  52.1 
 
 
168 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  52.63 
 
 
170 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  52.66 
 
 
167 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  52.02 
 
 
171 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  52.66 
 
 
167 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  50 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  51.46 
 
 
170 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  52.66 
 
 
167 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  51.5 
 
 
168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  52.07 
 
 
167 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  47.67 
 
 
177 aa  163  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  52.66 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  52.38 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  50.86 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  51.19 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  52.07 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  52.66 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  53.57 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  49.13 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  50 
 
 
174 aa  161  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  47.7 
 
 
171 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  54.72 
 
 
173 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  49.13 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  49.13 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  51.5 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  48.84 
 
 
170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  48.84 
 
 
170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  49.71 
 
 
173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  53.09 
 
 
170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  51.79 
 
 
167 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  51.5 
 
 
168 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  48.55 
 
 
171 aa  160  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  51.46 
 
 
177 aa  160  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  51.48 
 
 
216 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  51.48 
 
 
179 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  50.88 
 
 
177 aa  160  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  52.91 
 
 
178 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  51.48 
 
 
167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  51.48 
 
 
167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  48.26 
 
 
177 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  48.26 
 
 
177 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  47.43 
 
 
168 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  51.48 
 
 
167 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  46.11 
 
 
175 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  51.48 
 
 
179 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  49.4 
 
 
169 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  48.02 
 
 
182 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  51.48 
 
 
179 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  51.48 
 
 
179 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  47.98 
 
 
168 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  48 
 
 
168 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  48 
 
 
168 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  48 
 
 
168 aa  158  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  49.7 
 
 
171 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  47.13 
 
 
172 aa  158  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  47.09 
 
 
170 aa  158  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  48.52 
 
 
174 aa  158  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  46.71 
 
 
175 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  45.66 
 
 
169 aa  157  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  47.98 
 
 
168 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  47.98 
 
 
168 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  49.42 
 
 
169 aa  157  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>