More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0124 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  46.39 
 
 
697 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  45.66 
 
 
701 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  46.28 
 
 
694 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  45.95 
 
 
697 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  45.81 
 
 
701 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  45.52 
 
 
697 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  45.78 
 
 
694 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  100 
 
 
707 aa  1459    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  43.93 
 
 
692 aa  623  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  44.51 
 
 
691 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  42.88 
 
 
695 aa  591  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.97 
 
 
692 aa  589  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  42.53 
 
 
691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  42.59 
 
 
689 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  41.94 
 
 
697 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  41.29 
 
 
695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  40.38 
 
 
689 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  41.04 
 
 
692 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  41.04 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  41.76 
 
 
690 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  41.11 
 
 
689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  42.03 
 
 
691 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  40.75 
 
 
692 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  40.75 
 
 
692 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  40.9 
 
 
692 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  40.75 
 
 
692 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  40.9 
 
 
692 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  39.86 
 
 
699 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  39.86 
 
 
699 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  39.74 
 
 
692 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  40.61 
 
 
692 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.99 
 
 
691 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  41.84 
 
 
692 aa  556  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  40.61 
 
 
692 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  40.32 
 
 
692 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  40.82 
 
 
692 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  41.9 
 
 
691 aa  552  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  40.17 
 
 
692 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  41.55 
 
 
697 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  40.9 
 
 
692 aa  555  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  41.33 
 
 
701 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  40.26 
 
 
679 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  39.71 
 
 
699 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  40.35 
 
 
691 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  40.82 
 
 
692 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  40.2 
 
 
691 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  41.45 
 
 
691 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  40.2 
 
 
691 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  39.71 
 
 
699 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  39.3 
 
 
693 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  40.12 
 
 
692 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  39.53 
 
 
692 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  40.26 
 
 
704 aa  544  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  41.52 
 
 
680 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  39.8 
 
 
697 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  39.16 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.71 
 
 
700 aa  541  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  40.2 
 
 
692 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  40.96 
 
 
693 aa  538  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  39.21 
 
 
697 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  39.21 
 
 
697 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  39.77 
 
 
692 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  39.07 
 
 
693 aa  536  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  39.71 
 
 
697 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  40.26 
 
 
692 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  40.17 
 
 
691 aa  535  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  39.57 
 
 
692 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  41.45 
 
 
688 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  41.07 
 
 
688 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  40.32 
 
 
691 aa  534  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  39.09 
 
 
693 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  41.34 
 
 
686 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  39.4 
 
 
704 aa  532  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  41.31 
 
 
686 aa  535  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  40.94 
 
 
701 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  40.94 
 
 
701 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  40.67 
 
 
693 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  39.6 
 
 
696 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  39.6 
 
 
696 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  39.88 
 
 
691 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  39.77 
 
 
692 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  40.09 
 
 
691 aa  533  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  40.09 
 
 
704 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  39.16 
 
 
694 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  39.16 
 
 
694 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  40.38 
 
 
693 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  38.49 
 
 
695 aa  531  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  40.17 
 
 
705 aa  529  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  38.75 
 
 
691 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  40.55 
 
 
706 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  38.74 
 
 
704 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  38.75 
 
 
691 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  39.16 
 
 
693 aa  530  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  40.2 
 
 
695 aa  526  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  39.26 
 
 
697 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  38.61 
 
 
691 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  39.39 
 
 
694 aa  528  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  39.47 
 
 
690 aa  526  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  38.97 
 
 
698 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  38.97 
 
 
698 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>