133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0112 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  883    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  60 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  40.38 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  38.46 
 
 		 399 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  40.14 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  37.91 
 
 		 411 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  36.74 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  36.77 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  37.73 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  36.26 
 
 		 395 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  36.41 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  37.26 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  37.59 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  35.7 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  36.63 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  26.01 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.73 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  25.19 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  25.19 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.02 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  25.45 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.6 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  24.81 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  22.72 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  30.77 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  24.56 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  21.84 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  21.84 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  23.64 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  24.16 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  25.74 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  22.5 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  26.65 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.19 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  23.17 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  21.89 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  22.81 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  29.38 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  23 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  23.33 
 
 		 390 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  22.86 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  21.88 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  21.98 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  23 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  26.82 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  25.17 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  20.98 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  21.79 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  21.79 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  23 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  22.75 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  20.05 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  23 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  23 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  23 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  23 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  23 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  23 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  21.79 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  22.64 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  22.11 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.21 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  21.37 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  22.47 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  23.81 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  26.51 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  27.37 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  25.82 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.04 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  31.78 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  24.55 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  21.01 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.85 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  22.8 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  33.94 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  25.67 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  21.61 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.87 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  33.33 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  23.68 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  25.56 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  24.08 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  29.91 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  26.03 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  21.68 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  28.25 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  21.2 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  21.2 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  22.25 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  20.64 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  23.77 
 
 		 393 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  21.28 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  34.38 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  33.02 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  32.26 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  25.4 
 
 		 416 aa  53.9  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  22.84 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>