More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0093 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0093  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  100 
 
 
433 aa  887    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  61.27 
 
 
427 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.03 
 
 
427 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.09 
 
 
426 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.56 
 
 
426 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.56 
 
 
426 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.33 
 
 
426 aa  524  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.33 
 
 
426 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.56 
 
 
426 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.56 
 
 
426 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.56 
 
 
426 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.56 
 
 
426 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  60.56 
 
 
426 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.09 
 
 
426 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.56 
 
 
426 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.33 
 
 
426 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.33 
 
 
426 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.33 
 
 
426 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.09 
 
 
426 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.62 
 
 
427 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.09 
 
 
426 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.09 
 
 
426 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.23 
 
 
428 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.86 
 
 
427 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.09 
 
 
426 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.39 
 
 
427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.15 
 
 
427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.15 
 
 
427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.24 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.92 
 
 
427 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.09 
 
 
427 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.98 
 
 
426 aa  512  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.92 
 
 
426 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.92 
 
 
427 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.15 
 
 
426 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.14 
 
 
426 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.45 
 
 
429 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.51 
 
 
430 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59 
 
 
431 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.29 
 
 
430 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.51 
 
 
430 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.51 
 
 
430 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.29 
 
 
427 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.28 
 
 
430 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.51 
 
 
430 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.06 
 
 
428 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.92 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.75 
 
 
438 aa  504  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.14 
 
 
426 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.58 
 
 
430 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.53 
 
 
427 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.52 
 
 
429 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.58 
 
 
428 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.58 
 
 
431 aa  502  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
428 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.76 
 
 
432 aa  503  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
430 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.38 
 
 
428 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.05 
 
 
426 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.76 
 
 
426 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.87 
 
 
428 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.77 
 
 
425 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.68 
 
 
428 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0610  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.64 
 
 
433 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59 
 
 
426 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.87 
 
 
427 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.59 
 
 
427 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.29 
 
 
427 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.88 
 
 
444 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.72 
 
 
428 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.75 
 
 
427 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.76 
 
 
427 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.98 
 
 
427 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.06 
 
 
430 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.44 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0558  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.44 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.655288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.18 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.1 
 
 
428 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.34 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.98 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0600  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.05 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.41 
 
 
444 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.29 
 
 
427 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.5 
 
 
433 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.19 
 
 
432 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2085  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.31 
 
 
435 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.81 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0113  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.31 
 
 
435 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.71 
 
 
626 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.98 
 
 
431 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.81 
 
 
425 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  57.04 
 
 
429 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.06 
 
 
430 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.19 
 
 
445 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2572  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
431 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.74 
 
 
427 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  58.39 
 
 
437 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.51 
 
 
429 aa  487  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.87 
 
 
425 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>