187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0086 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  40.15 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  38.02 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0085  flagellar protein FliS  43.43 
 
 
121 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  35.54 
 
 
140 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  40 
 
 
136 aa  85.1  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
139 aa  84  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  36.89 
 
 
301 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
140 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  36.97 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  36.97 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  36.43 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  35.66 
 
 
137 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  38.1 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  37.4 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  34.04 
 
 
275 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  35.09 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  36.8 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  37.17 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  36.45 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
286 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  35.9 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  35.11 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  28.69 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  31.78 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  30.58 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  35.58 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0763  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.392725  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  33.93 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  33.62 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  40.95 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  35.24 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  35 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  29.75 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  38.46 
 
 
136 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
133 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  30.08 
 
 
133 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  35.58 
 
 
132 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  35.58 
 
 
132 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  28.21 
 
 
121 aa  60.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  32.76 
 
 
137 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
133 aa  60.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  31.03 
 
 
125 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
126 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  34.62 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  34.02 
 
 
98 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  33.01 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
136 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  32.63 
 
 
137 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  28.47 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  32.28 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  32.63 
 
 
137 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  35.58 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  33.93 
 
 
133 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  32.5 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
136 aa  58.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
135 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  29.52 
 
 
132 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  27.5 
 
 
125 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
136 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  34.48 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  29.66 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  29.6 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  33.98 
 
 
142 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
130 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  27.73 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  29.09 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
128 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
134 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  30.08 
 
 
132 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  28.12 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  30.58 
 
 
136 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  32.73 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>