93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0085 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0085  flagellar protein FliS  100 
 
 
121 aa  243  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  43.43 
 
 
173 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  28.97 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  32.32 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  28.95 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  29.73 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  34.65 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  29.66 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  30.3 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  32.29 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  32.67 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  28.12 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  32.71 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  32.67 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  28.97 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  33.63 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  27.08 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
135 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  28.42 
 
 
144 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  31.68 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  26.72 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  28.72 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  32.97 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  31.87 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  26.73 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  27.08 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  30.17 
 
 
301 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  28.45 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  30.25 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  30.17 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  32 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  26.72 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  31.68 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  23 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  28.43 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  31.68 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  31.68 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  28.85 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  28.71 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  26.6 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  27.73 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  29.67 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  27.47 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
128 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  26.36 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  26.6 
 
 
136 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  25.53 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  25.66 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  30.77 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  25.53 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  25.77 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  24.47 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  28.28 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  29.17 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  25.53 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  32.61 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  32.61 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  25.53 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  28.42 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  29.7 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  24.78 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  29.29 
 
 
275 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  26.55 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  26.6 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  23.4 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  28.1 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  28.16 
 
 
286 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  27.08 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.8 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  27.19 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  25.23 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  23.4 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  32.5 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  23.4 
 
 
133 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  27 
 
 
137 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  23.4 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  32.29 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  26.42 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  26.13 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  26.89 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  26.72 
 
 
136 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  27.62 
 
 
248 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>